Detektion von SARS-CoV-2 (Coronavirus) für Forschungszwecke

11.09.2020

überblick über den SARS-CoV-2-Nachweisprozess (Coronavirus)

Im Dezember 2019 wurde in Wuhan, der Hauptstadt der chinesischen Provinz Hubei, der SARS-CoV-2 (ehemals 2019-nCoV) identifiziert. Aufgrund seiner raschen Ausbreitung mit mehr als 28.000.000 best?tigten F?llen bis Anfang September 2020 erkl?rte die Weltgesundheitsorganisation den Ausbruch zu einem ?ffentlichen Gesundheitsnotstand von internationaler Bedeutung.

Wichtige Fakten:

  • SARS-CoV-2: (+) ss-RNA-Virus
  • Verwandt mit SARS-CoV und MERS-CoV
  • Nachweis auf der Basis von PCR

Analytik Jena bietet ein breites Produktportfolio im Bereich der Nukleins?ureextraktion und PCR bzw. Real Time PCR mit sowohl Extraktionskits als auch erforderlichen Ger?ten an. Für Forschungzwecke zum Nachweis des SARS-CoV-2 wird folgender Workflow vorgeschlagen.

1. Probennahme

Prinzipiell eignet sich Atemmaterial wie Nasen-Rachen- und Oropharynxabstrichproben für den Nachweis respiratorischer Erreger. Für n?here Informationen sind Empfehlungen der WHO oder sonstiger Institutionen zu beachten.
Weiterhin kann Serum für serologische Tests, Akutproben und Rekonvaleszenzproben genutzt werden.

2. Nukleins?ure-Extraktion

Analytik Jena bietet eine Auswahl an Extraktionsplattformen und zugeh?rigen Extraktionskits zur Extraktion viraler RNA aus Abstrichen, zellfreien K?rperflüssigkeiten (z.B. Serum, Plasma, Liquor) und mehr. Die Produktlinie innuPREP AniPath erm?glicht die gleichzeitige Extraktion von bakterieller und viraler DNA und/oder RNA aus den jeweiligen Ausgangsmaterialien. Eine detaillierte übersicht ist in der folgenden Tabelle dargestellt.

HandhabungProbendurchsatzExtraktionsplattformExtraktions-Kit
NameWichtige Merkmale
ManuellNiedrig
 
-Bis zu 12 Proben / 25 mininnuPREP Virus TS RNA Kit

 

Automatisiert

MittelInnuPure C16 touch

Bis zu 16 Proben / 31 - 84 min
Extraktionsplattform

innuPREP AniPath DNA/RNA Kit - IPC16, non-filled
innuPREP Virus DNA/RNA Kit - IPC16, non-filled
HochCyBio FeliX

Bis zu 96 Proben / 62 - 73 min
Extraktionsplattform + Liquid Handling
(z.B. Vorbereitung der PCR)

innuPREP AniPath DNA/RNA Kit – FX*
innuPREP Virus TS RNA Kit 2.0 - FX
Hoch
 
KingFisher Flex

Bis zu 96 Proben /  60 min
Ausschlie?lich Extraktionsplattform

innuPREP AniPath DNA/RNA Kit - KFFLX
innuPREP RNA Virus PLUS Kit – KFFLX

* Einführung geplant für Dezember 2020

3. Vervielf?ltigung und Detektion

Molekulare Assays zum Nachweis von SARS-CoV-2 sind über die Homepage der WHO zug?nglich. Darüber hinaus sind mehrere kommerzielle Real-time PCR-Kits erh?ltlich:

  • BGI Genomics: Real-Time Fluorescent RT-PCR Kit for Detecting SARS-2019-nCoV***
  • Fosun Pharma: Fosun COVID-19 RT-PCR Detection Kit***
  • Ingenetix: ViroReal ? SARS-CoV-2 & SARS****
  • Procomcure Biotech: PhoenixDx? SARS-CoV-2 IVD****
  • Primerdesign: 2019-nCoV genesig? Advanced kit***
  • R-Biopharm: RIDA?GENE SARS-CoV-2 RUO***
  • Seegene: AllplexTM 2019-nCoV Assay***
  • Siemens Healthineers: Fast Track Diagnostics SARS-CoV-2 Assay***
  • Shimadzu: 2019 Novel Coronavirus Detection Kit***
  • TIB MOLBIOL: LightMix? Modular SARS-CoV (COVID19) E-gene***
  • TIB MOLBIOL: LightMix? Modular SARS-CoV (COVID19) RdRP***
  • TIB MOLBIOL: LightMix? Modular EAV RNA Extraction Control***

*** best?tigte Kompatibilit?t mit qTOWER3
**** vom Assay-Hersteller auf qTOWERG validiert

Das PCR-Set kann mit einer Liquid-Handling-Plattform wie dem CyBio FeliX pipettiert werden. Die Verwendung einer PCR-Workstation oder -Kabinett bietet maximale Sicherheit und minimiert das Kontaminationsrisiko. Einzelne Komponenten wie Reverse Transkriptase sind ebenfalls über Analytik Jena erh?ltlich. Generell k?nnen alle Real-Time PCR-basierten Assays auf Real-Time Thermocyclern, wie etwa der  qTOWER3-Familie von Analytik Jena, durchgeführt werden. Informationen zu weiteren kommerziellen qPCR Assays zum SARS-CoV-2 Detektion mit best?tigten Kompatibilit?ten auf qTOWER3 Ger?ten erhalten Sie gern auf Anfrage.

Bitte beachten Sie, dass alle hier aufgeführten Produkte der Analytik Jena AG soweit nicht explizit als CE-IVD gekennzeichnet, ausschlie?lich für Forschungszwecke bestimmt sind.

Downloads

Flyer Workflow detection of SARS-CoV-2 (English)

PDF ?ffnen

Implementation of SARS-CoV-2 (Coronavirus) detection assays from TIB MOLBIOL on qTOWER3 for research use

PDF ?ffnen

Web-Seminar Biofoundries and SARS-CoV-2 diagnostics

Mehr erfahren: Web-Seminar Biofoundries and SARS-CoV-2 Diagnostics

Feedback

Kommentare (17)

  • Abhimanyu Pandey

    thank you
    • Analytik Jena AG

      You are welcome!
  • Mustakim,MD,Clin.Path

    Thank you,I am User Analytic Jenna PCR labkesda Soppeng From South Celebes Indonesia.
  • Florian Werner

    We have also validated our Kylt SARS-CoV-2 Kits on the qTower 384. Very satisfied with the performance and results. (https://www.kylt.eu/de/products/show/more/454)
  • Bhuneshwar Behra

    Thank you
  • Sunil Prasad Lekhak

    Dear Sir/Madam

    We are trading company in Nepal, specialized in Molecular Diagnostic lab.
    Currently we are looking for Fully automated Nucleic acid extraction system and liquid handling system.
    I am very much interested in your CyBio Felix system.

    Could you please send me technical specifications and Distributor Price for Nepal.

    Looking forward to your reply.

    Sunil Prasad Lekhak

    Life Sciences Solutions Pvt. Ltd.
    • Analytik Jena AG

      Thank you for your inquiry. We have forwarded your request to our sales team which will contact you as soon as possible.
  • Jazz

    I Am looking into doing research for covid kit for salmon , poultry etc sample, can I ask if your kit suitable for animal sample ? What is the price to run a covid test? If the test including extraction and regained as well? Can you quote both ? What is the lead time and shelf life of this ?
    • Analytik Jena AG

      Thank you for your inquiry. Our sales team will contact you shortly to answer your questions.
  • Mario Schwarzkopf

    Hallo, ich Interessiere mich auch für ein Kit mit dem schnellstm?glich das Virus nachgewiese, bzw. ausgeschlossen werden kann. Ich br?uchte alle Ger?tschaften, die Notwendig w?ren um dies für eine Mobile Prüfung zu nutzen. Würde mich über n?here Informationen und Preise freuen.

    Beste Grü?e
    :Schwarzkopf
    • Analytik Jena AG

      Hallo Herr Schwarzkopf, wir haben Ihre Anfrage an unser Sales-Team weitergeleitet, welches die genauen Einsatzzwecke und Gegenheiten mit Ihnen abkl?ren wird.
  • Sara Sánchez

    Cordial saludo,

    Quisiera saber si hay un proceso de validación con el kit comercial Molecutech Real Time COVID-19 el cual nos puedan compartir. O si hay opción de hacer una capacitación virtual para la interpretación de los resultados de las corridas realizadas con el qTower 3 y el Kit de Molecutech.
    • Analytik Jena AG

      Dear Mrs. Sánchez, right now the kit isn't validated on qTOWER3 yet. Please contact our application specialists at [email protected] I'm sure that you will find an appropriate solution for your setup together.
  • Mudhafar

    Are SARS-CoV-2 (Coronavirus) Kits from Analyticgena Working with Applied Biosystem 7500 fast Device?
    • Analytik Jena AG

      Analytik Jena offers various nucleic acid extraction kits which can be used for the purification of viral RNA such as the SARS-CoV-2. For the subsequent detection via RT real time PCR on the one hand the PCR assay amplifying SARS-CoV-2-specific targets via distinct fluorescent dyes or probes is required. Such SARS-CoV-2 assays are not part of Analytik Jena's product portfolio. On the other hand a real time cycler is needed (which is offered by AJ). The PCR Assay and real time cyclers have to be compatible. The sample preparation via nucleic acid extraction does not affect the real time cycler so it is no problem to do nucleic acid extraction with kits by Analytik Jena and PCR with any cyler such as the Applied Biosystem 7500 fast Device .
  • Michael

    What cell free body fluid is the “liquor” part? That is from your web site above:

    2. Nucleic Acid Extraction
    Analytik Jena offers a choice of extraction platforms and related extraction kits for extraction of viral RNA from swabs, cell free body fluids (e.g. serum, plasma, liquor) and more.
    • Analytik Jena AG

      The aforementioned body fluid is cerebrospinal fluid. Thank you for the hint! We have corrected the text passage.

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